Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC66A2RUB6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC66A2RUB6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms