Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIPSLA2A3N6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms