Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KCNK10-201ENST00000312350 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DAW1-201ENST00000309931 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KCNH5-203ENST00000394968 2490 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GULP1-201ENST00000359135 3347 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SYT2-201ENST00000367267 7614 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PLAGL1-203ENST00000367571 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL158847.1-201ENST00000431955 808 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HAP1-203ENST00000347901 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 COX15-201ENST00000016171 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SEMA4A-204ENST00000368285 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SYT16-201ENST00000430451 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 FRG2C-201ENST00000308062 2078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 FRG2C-202ENST00000464571 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 Z93929.2-201ENST00000615011 2623 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 FRMPD1-202ENST00000377765 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LINC01346-201ENST00000412674 3242 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NLRP12-205ENST00000391775 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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