Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYQ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYQ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYQ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYQ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYQ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYQ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYQ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYQ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYQ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYQ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYQ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYQ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYQ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYQ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYQ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms