Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQE9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQE9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQE9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQE9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms