Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC4Q9Y696 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC4Q9Y696 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms