Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNPO3Q9Y5L0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNPO3Q9Y5L0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms