Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTDP1Q9Y5B0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDP1Q9Y5B0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms