Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HES2Q9Y543 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms