Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB1Q9Y478 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms