Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms