Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MRPL11Q9Y3B7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms