Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM2Q9Y2K5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM2Q9Y2K5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms