Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BTRCQ9Y297 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BTRCQ9Y297 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms