Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y279

VSIG4, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG4Q9Y279 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VSIG4Q9Y279 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms