Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF9BQ9UPX0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms