Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms