Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms