Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTF2Q9UNY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF2Q9UNY4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms