Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms