Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms