Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms