Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPDR1Q9UM22 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms