Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC7AQ9ULT0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms