Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PADI1Q9ULC6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PADI1Q9ULC6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms