Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms