Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms