Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NRXN1Q9ULB1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
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