Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AMFRQ9UKV5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMFRQ9UKV5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms