Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXL4Q9UKA2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXL4Q9UKA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms