Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms