Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms