Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRAQ9UJ68 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms