Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC5Q9UII4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC5Q9UII4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms