Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD2Q9UGT4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.7 ms