Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
IFT172Q9UG01 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFT172Q9UG01 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms