Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT8Q9UFF9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms