Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB4Q9UDY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms