Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK4Q9UBT3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK4Q9UBT3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms