Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms