Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPASTQ9UBP0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPASTQ9UBP0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms