Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms