Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CC2D2AQ9P2K1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CC2D2AQ9P2K1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC39.51■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CC2D2AQ9P2K1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms