Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms