Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms