Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MBD5Q9P267 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD5Q9P267 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms