Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAPAQ9P0L0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms