Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOFQ9NZM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms