Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBP1Q9NZI7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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