Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms